《四库全书》本应该可以做到超越《永乐大典》，成为从古至今最著名的古代典籍，奈何在《四库全书》在编撰时，是乾隆皇帝以“稽古右文”为名，推行文化专制政策的产物，乾隆皇帝把对不利于清朝统治的书籍，分别采取全毁、抽毁和删改的办法，销毁和篡改了大批文献。
除此以外，它严重突出了儒家文献和反映清朝统治者“文治武功”的文献，把儒家著作放在突出的位置，把儒家经典放在四部之首，把一般儒家著作放在子部之首。
同时，它极度轻视科技著作，认为西方现代科学技术是“异端之尤”，可以“节取其技能，禁传其学术”。除了农家、医家和天文算法类收录少数科技著作之外，一般科技著作全都不予收录，而且它还排斥了所有民主色彩或敢于批评儒家思想的文献及戏曲和通俗如宋元杂剧、话本、明代传奇等。
在此情况下，《四库全书》注定不可能胜过于《永乐大典》，因为这两部典籍在著作之初，立意和格局就已经高低立判了，而这也是只有《永乐大典》才有资格被称为是“万书之书”的缘由……